| Published: 

Biomolekulák jellemzése DSC-vel: lizozim

Bevezetés

A lizozim vagy muramidáz egy olyan enzimcsoport neve, amely hidrolizálja a peptidoglikánokat, egy cukrokból és aminosavakból álló szerkezeti makromolekulát, amely a baktériumsejtek külső falának védőrétegét alkotja. A lizozim széles körben elterjedt a természetben, jelen van állatokban, növényekben, baktériumokban és bakteriofág vírusokban is. A baktériumfertőzés ellen ható veleszületett immunrendszer része. Megtalálható a testváladékokban, mint a nyál és a könny, a szövetekben és a szervekben is. Antibakteriális és gombaellenes aktivitása miatt a lizozim potenciálisan alkalmazható a klinikai, takarmányozási és élelmiszeripari alkalmazásokban [2]. Emellett széles körben alkalmazzák modellmolekulaként a fehérjék szerkezetének, stabilitásának és működésének vizsgálatára számos kutatási területen [3].

A lizozim egy small globuláris fehérje, amelynek kémiai szerkezete hasonló a különböző élőlényekben, amelyekben jelen van, lásd az 1. ábrát. A különböző típusú lizozimeket három fő családba sorolják: csirke-típusú, libatípusú és gerinctelen típusú. Az emberi és a csirke lizozimeket a csirke-típusúak közé soroljuk, aminosav-szekvenciájuk közel 60%-ban megegyezik, míg a csirke lizozim 129 aminosavmaradványból áll (14,3 kDa), az emberi lizozim 130-ból (14,7 kDa). A tyúktojásfehérje a lizozim fő kereskedelmi forrása [2,3]. Az úgynevezett tyúktojásfehérje-lizozim (HEWL) a large pH-tartományban (6-9) aktív, és 72°C-os olvadási/átmeneti hőmérsékletet (Tm) képvisel pH 5,0-nál [4].

A DSC-t nagymértékben alkalmazzák a fehérjék és fehérjeformulációk HőstabilitásEgy anyag hőstabil, ha a hőmérséklet hatására nem bomlik el. Egy anyag hőstabilitásának meghatározására a TGA (termogravimetriás analizátor) egyik módja. hőstabilitásának vizsgálatára. A fehérje kibontakozása egy endoterm hatás, amely a fehérje hidrofób csoportjainak a vizes medium kitettségéből adódik. Ezért az oldatban lévő fehérjék esetében a DSC-görbén gyakran megfigyelhető egy hőelnyelési csúcs, amelynek csúcsmaximumát a szakirodalom olvadási/átmeneti hőmérsékletnek (Tm) nevezi. A termikus denaturáció (a fehérje 3 dimenziós szerkezetének kibomlása) lehet reverzibilis vagy irreverzibilis, a fehérje jellemzőitől és a körülményektől függően medium, 2. ábra [5]. Medium A denaturáció reverzibilitását befolyásoló körülmények közé tartozik például a fehérje koncentrációja, a pH, a Ionic erőssége és a hőmérséklet. Ezért várható, hogy a fehérje szerkezetében vagy a formulációban medium bekövetkező változások befolyásolhatják a fehérjék termosztabilitását, ami a mért Tm-ben tükröződik.

A DSC közvetlenül a kibontakozási folyamathoz kapcsolódó hőfelvételt méri. Megbízható módszer a natív fehérje termodinamikai jellemzőinek meghatározására a szerkezeti módosításokon átesett fehérjék jellemzésére vagy a terápiás célú fehérjeformulák HőstabilitásEgy anyag hőstabil, ha a hőmérséklet hatására nem bomlik el. Egy anyag hőstabilitásának meghatározására a TGA (termogravimetriás analizátor) egyik módja. hőstabilitásának elérésére.

1) A tyúktojásfehérje lizozim 3D szerkezete [1].
2) A fehérjék denaturálásának és renaturálásának sematikus példája.

Kísérleti

Minta előkészítési módszer

A lizozimet1 desztillált és szűrt2 vízben 300 mg/ml, 200 mg/ml, 24 mg/ml és 5 mg/ml koncentrációban oldottuk. minden koncentrációból 20 μl-t pipettáztunk a Concavus®tégelyekbe3, amelyeket azonnal lezártunk. A 24 mg/ml-es oldat esetében 5 μl térfogatot is elemeztünk. Minden mintán legalább három mérést végeztünk. A referenciatégelyt ugyanolyan térfogatú desztillált, szűrt vízzel töltöttük meg. A méréseket inert légkörben (dinamikus N2, 40 ml/perc) végeztük 10 K/perc fűtési sebességgel.

1 Tyúktojásfehérje lizozim, ≥ 45 000 FIP U/mg, liofilizált, 14 kDa, Carl Roth GmbH + Co KG
2 Poliéter-szulfon - PES membránszűrő, 450 μm
3 Concavus® 40 μl-es alumínium tégelyek, NETZSCH-Gerätebau GmbH

Mérési eredmények és megbeszélés

A lizozim vizes oldatainak DSC-görbéi minden mért koncentráció esetében a 75°C-os tartományban a tipikus egyszeri endoterm hatást mutatják. A 3. ábra 300, 200 és 20 mg/ml koncentrációjú oldatok tipikus görbéit mutatja. Az extrapolált kezdeti hőmérséklet, a csúcshőmérséklet (Tm) és a görbe alatti terület (entalpia) a koncentráció függvényében változik. Minél nagyobb a tégelyben lévő minta tömege, annál szélesebb az endoterm hatás. A kiszélesedő hatás az extrapolált kezdeti és csúcshőmérséklet, valamint az entalpia változása során figyelhető meg. A választott koncentrációk reprezentatívak a szokásos terápiás fehérje drogokra, amelyek általában nagy koncentrációjúak, a fehérje adagját testtömeg mg/kg-ban adtuk meg. A 4. ábra a mintatérfogat hatását mutatja be a 20 mg/ml (5 μl) és az 5 mg/ml (20 μl) oldatok DSC-görbéinek megjelenítésével.

A megfelelő tömegek 0,13 mg és 0,10 mg voltak. Az összes mérés eredményeit az 1. táblázatban foglaltuk össze.

3) DSC-mérés lizozim 300 mg/ml (kék görbe), 200 mg/ml (zöld görbe) és 20 mg/ml (lila görbe) esetén. A minta térfogata: 20 μl.
4) DSC-mérés lizozim 20 mg/ml (lila görbe), 5 mg/ml (világoskék görbe) esetén. A minta térfogata: 5 μl, illetve 20 μl.

1. táblázat: A lizozim jellemzése DSC-vel: koncentráció, fehérjetömeg, a mért minták térfogata és a megfelelő átmeneti hőmérsékletek (csúcsok) és entalpiák (területek)

Koncentráció

(mg/ml)

Minta térfogata

(μl)

Koncentráció

(mM)

Fehérje tömege

(mg)

Terület

(J/g)

Csúcs

(°C)

3002021.46.37 ± 0.347.41 ± 0.1273.0 ± 0.2
2002014.34.26 ± 0.143.56 ± 0.1476.2 ± 0.4
20201.70.51 ± 0.00.69 ± 0.0577.4 ± 0.5
2051.70.10 ± 0.00.78 ± 0.1176.6 ± 0.2
5200.360.10 ± 0.00.33 ± 0.1979.3 ± 0.5

Összefoglaló

Ebben a tanulmányban a DSC 300 Caliris® készüléket használták a lizozim átmeneti hőmérsékletének vizsgálatára széles koncentrációtartományban, 5 és 300 mg/ml között, ami reprezentatív a kereskedelemben kapható fehérjeformulákra. Bár nagy koncentrációjú oldatokat használtunk, a small 5 μl-es térfogatokon végzett mérés lehetővé tette a drága készítmények megtakarítását nagy reprodukálhatóság mellett.

A szenzor érzékenysége és a small néhány mikroliteres térfogatok használatának lehetősége, valamint az automatizált mintaváltó lehetősége a DSC-t értékes technikává teszi a biomolekulák elemzésében. A fűtési/hűtési sebességtől függően az átviteli sebesség elérheti az óránkénti 3 mintát is.

Literature

  1. [1]
    A tyúktojásfehérje lizozim szerkezetének valós térbeli finomítása (2024. június),https://www.rcsb.org/structure/2lyz
  2. [2]
    Ferraboschi, P., et al (2021). A lizozim, egy veleszületett immunvédelmi tényező, mint alternatív antibiotikum alkalmazásai. In Antibiotikumok (10. évfolyam, 12. szám). MDPI. doi.org/10.3390/antibiotics10121534
  3. [3]
    Rajaram S. et al, Lysozyme: A model protein for amyloid research, Editor(s): Rossen Donev, Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, Academic Press, Volume 84, 2011, Pages 63-111, ISSN 1876-1623, ISBN 9780123864833.
  4. [4]
    Venkataramani, S., et al (2013). A nagy koncentrációjú lizozim hőstabilitása változó pH-n: Fourier transzformációs infravörös vizsgálat. Journal of Pharmacy and Bioallied Sciences, 5(2), 148-153. doi.org/10.4103/0975-7406.111821
  5. [5]
    Johnson, C. M. (2013). A differenciális pásztázó kalorimetria mint a fehérjék hajtogatásának és stabilitásának eszköze. In Archives of Biochemistry and Biophysics (Vol. 531, Issues 1-2, pp. 100-109). Academic Press Inc. doi.org/10.1016/j.abb.2012.09.008.