| Published: 

Характеристика биомолекул с помощью ДСК: лизоцим

Введение

Лизоцим, или мурамидаза, - название группы ферментов, гидролизующих пептидогликаны, структурные макромолекулы, состоящие из сахаров и аминокислот, образующие защитный слой на внешней стенке бактериальных клеток. Лизоцим широко распространен в природе, он присутствует в организме животных, растений, бактерий, а также в вирусах-бактериофагах. Он является частью врожденной иммунной системы, действующей против бактериальной инфекции. Его можно обнаружить в секретах организма, таких как слюна и слезы, тканях, а также в органах. Благодаря своей антибактериальной и противогрибковой активности лизоцим может найти применение в клинической практике, кормах и продуктах питания [2]. Он также широко применяется в качестве модельной молекулы для исследования структуры, стабильности и функции белков в нескольких областях исследований [3].

Лизоцим - это глобулярный белок small, имеющий сходную химическую структуру у различных живых существ, в которых он присутствует, см. рисунок 1. Различные типы лизоцимов делятся на три основных семейства: куриный тип, гусиный тип и беспозвоночный тип. Лизоцимы человека и курицы относятся к куриному типу и почти на 60 % идентичны по аминокислотной последовательности, в то время как лизоцим курицы состоит из 129 аминокислотных остатков (14,3 кДа), лизоцим человека - из 130 (14,7 кДа). Белок куриного яйца является основным коммерческим источником лизоцима [2,3]. Так называемый лизоцим белка куриного яйца (HEWL) активен в диапазоне рН large (6 - 9) и имеет температуру плавления/перехода Tm 72°C при рН 5,0 [4].

ДСК в значительной степени применяется для изучения термической стабильности белков и белковых рецептур. Разворачивание белка - это эндотермический эффект, возникающий в результате воздействия его гидрофобных групп на водный раствор medium. Поэтому для белков в растворах на кривой ДСК часто наблюдается пик поглощения тепла, максимум которого в литературе называют температурой плавления/перехода (Tm). Термическая денатурация (разворачивание 3-мерной структуры белка) может быть обратимой или необратимой, в зависимости от характеристик белка и условий medium, рисунок 2 [5]. Medium условия, влияющие на обратимость денатурации, включают, например, концентрацию белка, pH, Ionic силу и температуру. Поэтому ожидается, что изменения в структуре белка или в рецептуре medium могут влиять на термостабильность белков, что отражается на измерении Tm.

ДСК напрямую измеряет поглощение тепла, связанное с процессом разворачивания. Это надежный метод определения термодинамических характеристик нативного белка для характеристики белков, подвергшихся структурным модификациям, или для доступа к термической стабильности белковых составов для терапевтического использования.

3D-структура лизоцима белка куриного яйца, демонстрирующая его разноцветные альфа-гели и бета-листы, подчеркивающие сворачивание белка.
1) 3D-структура лизоцима белка куриного яйца [1].
Lambda анализ значений 90/90 с помощью программного обеспечения SmartMode, отображение статистики и результатов испытаний на теплопроводность.
2) Схематический пример денатурации и ренатурации белков.

Экспериментальный

Метод подготовки образцов

Лизоцим1 был солюбилизирован в дистиллированной и фильтрованной2 воде в концентрациях 300 мг/мл, 200 мг/мл, 24 мг/мл и 5 мг/мл. по 20 мкл раствора каждой концентрации пипетировали в тигли Concavus® 3, которые сразу же герметично закрывали. Для раствора с концентрацией 24 мг/мл также анализировался объем 5 мкл. Для каждого образца проводилось не менее трех измерений. Контрольный тигель заполняли таким же объемом дистиллированной фильтрованной воды. Измерения проводились в инертной атмосфере (динамический N2, 40 мл/мин) при скорости нагрева 10 К/мин.

1 Лизоцим из белка куриного яйца, ≥ 45 000 FIP U/mg, лиофилизированный, 14 кДа, Carl Roth GmbH + Co KG
2 Полиэфирсульфон - мембранный фильтр PES, 450 мкм
3 Concavus® 40 мкл алюминиевые тигли, NETZSCH-Gerätebau GmbH

Результаты измерений и обсуждение

Кривые ДСК водных растворов лизоцима демонстрируют типичный единичный эндотермический эффект в диапазоне 75°C для всех измеренных концентраций. На рисунке 3 представлены типичные кривые растворов с концентрациями 300, 200 и 20 мг/мл. Экстраполированная температура начала, температура пика (Tm) и площадь под кривой (энтальпия) изменяются в зависимости от концентрации. Чем больше масса образца в тигле, тем шире эндотермический эффект. Эффект расширения наблюдается при изменении экстраполированных начальной и пиковой температур, а также энтальпии. Выбранные концентрации являются репрезентативными для обычных терапевтических белковых препаратов, которые обычно являются высококонцентрированными, а дозировка белка указана в мг/кг массы тела. Рисунок 4 демонстрирует влияние объема образца, показывая кривые ДСК растворов 20 мг/мл (5 мкл) и 5 мг/мл (20 мкл).

Соответствующие массы составили 0,13 мг и 0,10 мг. Результаты всех измерений сведены в таблицу 1.

График дифференциальной сканирующей калориметрии (ДСК) лизоцима при различных концентрациях, иллюстрирующий термические переходы и пиковые температуры.
3) Измерение ДСК лизоцима в концентрации 300 мг/мл (синяя кривая), 200 мг/мл (зеленая кривая) и 20 мг/мл (фиолетовая кривая). Объем образца: 20 мкл.
График ДСК лизоцима в концентрации 20 мг/мл (фиолетовый) и 5 мг/мл (светло-голубой), отображающий температурные пики и данные о наступлении температуры.
4) Измерение ДСК лизоцима в концентрации 20 мг/мл (фиолетовая кривая), 5 мг/мл (светло-голубая кривая). Объем образца: 5 мкл и 20 мкл, соответственно.

Таблица 1: Характеристика лизоцима с помощью ДСК: концентрация, масса белка, объемы измеренных образцов и соответствующие температуры перехода (пики) и энтальпии (площади)

Концентрация

(мг/мл)

Объем образца

(мкл)

Концентрация

(мМ)

Масса белка

(мг)

Площадь

(Дж/г)

Пик

(°C)

3002021.46.37 ± 0.347.41 ± 0.1273.0 ± 0.2
2002014.34.26 ± 0.143.56 ± 0.1476.2 ± 0.4
20201.70.51 ± 0.00.69 ± 0.0577.4 ± 0.5
2051.70.10 ± 0.00.78 ± 0.1176.6 ± 0.2
5200.360.10 ± 0.00.33 ± 0.1979.3 ± 0.5

Резюме

В данном исследовании DSC 300 Caliris® был использован для изучения температуры перехода лизоцима в широком диапазоне концентраций, от 5 до 300 мг/мл, что соответствует коммерчески доступным белковым составам. Несмотря на то, что использовались высококонцентрированные растворы, измерения на объемах small от 5 мкл позволили сохранить дорогостоящие составы с высокой воспроизводимостью.

Чувствительность датчика и возможность использования объемов small в диапазоне нескольких микролитров, а также возможность автоматической смены образцов делают ДСК ценным методом для анализа биомолекул. В зависимости от скорости нагрева/охлаждения производительность может достигать 3 образцов в час.

Literature

  1. [1]
    Уточнение структуры лизоцима белка куриного яйца в реальном пространстве (июнь 2024 г.),https://www.rcsb.org/structure/2lyz
  2. [2]
    Феррабоски, П., и другие (2021). Применение лизоцима, фактора врожденной иммунной защиты, в качестве альтернативного антибиотика. В журнале Antibiotics (том 10, выпуск 12). MDPI. doi.org/10.3390/antibiotics10121534
  3. [3]
    Раджарам С. и др, Лизоцим: модельный белок для исследования амилоида, Редактор(ы): Россен Донев, Успехи химии белка и структурной биологии, Академическая пресса, том 84, 2011, страницы 63-111, ISSN 1876-1623, ISBN 9780123864833.
  4. [4]
    Венкатарамани, С., и другие (2013). Термическая стабильность лизоцима высокой концентрации при изменении pH: Инфракрасное исследование с преобразованием Фурье. Journal of Pharmacy and Bioallied Sciences, 5(2), 148-153. doi.org/10.4103/0975-7406.111821
  5. [5]
    Джонсон, К. М. (2013). Дифференциальная сканирующая калориметрия как инструмент для изучения сворачивания и стабильности белков. В Архивах биохимии и биофизики (том 531, выпуски 1-2, стр. 100-109). Academic Press Inc. doi.org/10.1016/j.abb.2012.09.008.
AI Overview
An error occurred. Please try again.